La construction d’un discours sur la gouvernance n’étant pas une fin en soi, l’Alliance cherche à traduire sur le terrain les propositions de refondation de la gouvernance. Ce but justifie le passage d’un réseau à une alliance d’acteurs pour le changement qui associe à la fois des acteurs étatiques et non-étatiques. Le concept opératoire de mise en œuvre de cette stratégie est constitué par les groupes d’initiative, espaces régionaux de dialogue, de réflexion, de proposition et d’expérimentation des innovations dans les modes de gouvernance. L’Alliance a ainsi créé quatre groupes travaillant chacun sur thème spécifique : Gouvernance, Décentralisation et Développement local ; Gouvernance, Culture et Pluralisme Juridique ; Gouvernance et régulation des conflits ; Gouvernance et Politiques Economiques. Ces groupes sont complétés par un groupe sur le dialogue Afrique-Europe pour la refondation de la coopération au développement, groupe qui est constitué de partenaires européens et africains.